COVID-19 大流行已經(jīng)持續(xù)了近 3 年，目前仍然是一個(gè)全球關(guān)注的熱點(diǎn)話題。鑒于新冠病毒的廣泛傳播和不斷演變，全球出現(xiàn)了眾多變種，比如 alpha (B.1.1.7)、beta (B.1.351)、gamma (P.1)、delta (B.1.617.2)、omicron (B.1.1.529) 等。其中，Omicron *早在南非被發(fā)現(xiàn)，增加的高傳播力使其迅速成為全球范圍內(nèi)的優(yōu)勢(shì)毒株。

2022 年 12 月之前，中國(guó)采取了與其他國(guó)家不同的應(yīng)對(duì)策略，從 2020 年的武漢封城到動(dòng)態(tài)清零政策，精準(zhǔn)防控，阻止了新冠病毒的傳播。隨著 Omicron 亞變體致病性的減弱、疫苗接種的普及和防控經(jīng)驗(yàn)的積累，2022 年 11 月中旬，中國(guó)調(diào)整和優(yōu)化了預(yù)防和控制策略。

中國(guó)在調(diào)整防控政策后，疫情在中國(guó)的快速傳播引起了世界的關(guān)注，并引發(fā)了人們對(duì)此次疫情是否會(huì)驅(qū)動(dòng)新 SARS-CoV-2 變體出現(xiàn)的擔(dān)憂。因此，對(duì)流行的 SARS-CoV-2 變體進(jìn)行**的時(shí)空研究，對(duì)于全球應(yīng)對(duì)當(dāng)前的 COVID-19 大流行至關(guān)重要。北京擁有常住人口 2100 萬，在政策調(diào)整后初期成為中國(guó)病例數(shù)*多的城市之一。因此，北京 SARS-CoV-2 變種的流行可以被視為中國(guó)的一個(gè)縮影。

2023 年 2 月 8 日，北京疾控中心副主任王全意團(tuán)隊(duì)聯(lián)合高福院士團(tuán)隊(duì)在國(guó)際權(quán)威醫(yī)學(xué)期刊《柳葉刀》發(fā)表了題為：Characterisation of SARS-CoV-2 variants in Beijing during 2022: an epidemiological and phylogenetic analysis 的論文，**描述了 2022 年收集的高質(zhì)量 SARS-CoV-2 全基因組序列的流行病學(xué)和系統(tǒng)發(fā)育特征，并特別報(bào)道分析了政策調(diào)整后 SARS-CoV-2 的基因組特征，為北京市疫情提供了重要信息。

其中，從 2022 年 11 月 14 日到 12 月 20 日獲得的 413 個(gè) COVID-19 感染樣本的基因組測(cè)序分析結(jié)果表明，所有病例均由現(xiàn)有毒株引起，北京地區(qū) 90% 以上的本地感染病例涉及 Omicron 變異株 BA.5.2 和 BF.7，沒有持續(xù)的顯性變異或新的譜系產(chǎn)生

2022 年 1 月 1 日至 11 月 30 日，北京市共監(jiān)測(cè)到 39007 例本地病例，5 歲以下和 60 歲以上的個(gè)體占 663 人  (1.70%)。由于戰(zhàn)略調(diào)整，自 11 月 14 日起，感染人數(shù)明顯增加，因此，當(dāng)?shù)?11 月 30 日至 12 月 28 日的準(zhǔn)確感染人數(shù)是未知的，只能通過統(tǒng)計(jì)推斷得到。

北京市 2022 年檢測(cè)到的本地和輸入性病例中，實(shí)驗(yàn)室確診病例共計(jì) 3745 例，本研究從中隨機(jī)選取病例進(jìn)行基因組測(cè)序，共獲得 2994 個(gè)完整的 SARS-CoV-2 基因組，其中 2881 個(gè)是高質(zhì)量基因組，可用于進(jìn)一步分析。這些序列的采樣時(shí)間跨度為全年，采樣地點(diǎn)覆蓋了北京市全部 17 個(gè)區(qū)。

詳細(xì)的分析表明，這些毒株來自 10 個(gè)演化支和 123 個(gè) Pango lineage。與本地病例相比，輸入性病例的分支范圍更廣。不過，在所分析的數(shù)據(jù)集中沒有發(fā)現(xiàn)新的 Pango lineage。此外，他們還發(fā)現(xiàn)了少量先前報(bào)道的重組 SARS-CoV-2 亞變體 XBB (n = 1)，XBB.1 (n = 9) 和 XBB.2 (n = 1)。從全年的角度來看，來自支系 21L (BA.2.2.1) 和 22B/Omicron (BF.7 和 BA.5.2) 在 2022 年期間主導(dǎo)了北京的流行感染。但 2022 年 11 月中旬之后，22B 在北京成為**主導(dǎo)流行毒株。

自 2022 年 11 月 14 日起，北京市新增確診病例大幅增加，共檢測(cè)確診病例 413 例，其中本地病例 350 例，境外輸入病例 63 例。在這些本地病例中，BF.7 占 265 株  (75.71%)，成為 11 月 14 日以后的優(yōu)勢(shì)菌株，BA.5.2（16.29%）和 BA.5.1（7.71%）分列**和第三。

他們進(jìn)一步將本地感染分為門診患者和住院患者，發(fā)現(xiàn)兩組中優(yōu)勢(shì)菌株均為 BF.7，這與局部感染總體一致，門診患者與住院患者的病毒株比例差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

因此，在中國(guó)取消*嚴(yán)格的疫情控制政策期間，對(duì)北京 413 例新感染 COVID-19 病例的基因組分析表明，所有病例都是由現(xiàn)有菌株引起的，并未出現(xiàn)新的變異株。

進(jìn)一步的系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)分析表明，BA.5.2 和 BF.7 的有效群體大小在 2022 年 11 月 14 日之后經(jīng)歷了擴(kuò)張，這表明這兩個(gè)毒株的遺傳多樣性有所增加。不過，BA.5.2 和 BF.7 的擴(kuò)張模式不同，BA.5.2 有效種群規(guī)模在 11 月 14 日至 25 日期間變化不大，但在 11 月 25 日前后急劇增加；而 BF.7 的增加卻是漸進(jìn)式的。北京市 BA.5.2 有效種群規(guī)模的突然擴(kuò)大與 11 月 30 日前后 BA.5.2 感染數(shù)量的增加是一致的。此外，在*近的疫情中，他們沒有發(fā)現(xiàn)任何新的 SARS-CoV-2 變種在北京傳播。

綜上所述，在本研究中，他們報(bào)告了 2022 年北京地區(qū) COVID-19 病例和 SARS-CoV-2 變體的傳播趨勢(shì)。流行病學(xué)調(diào)查和系統(tǒng)發(fā)育分析表明，本地和輸入性感染在譜系分布上存在顯著差異。2023 年 11 月 14 日至 12 月 20 日，BF.7 和 BA.5.2 在北京本地感染中占主導(dǎo)地位，沒有發(fā)現(xiàn)新的 SARS-CoV-2 變種在北京傳播。在同一時(shí)期，在國(guó)際上占主導(dǎo)地位的新冠病毒變體，包括 XBB 和 BQ.1，均未在北京市本地感染病例中檢出。總的來說，該研究可以被認(rèn)為是中國(guó)的一個(gè)縮影，因?yàn)橹袊?guó)的人交流頻繁，而且流行的菌株具有很高的傳播性。

該研究共同通訊作者、中國(guó)科學(xué)院微生物研究所高福院士說到：「考慮到變異對(duì)大流行過程的影響，檢測(cè)在中國(guó)*近改變 COVID-19 防控政策后是否出現(xiàn)了新的變異很重要。我們的分析表明，兩個(gè)已知的 Omicron 變異株亞分支，而不是任何新的變異株，是北京病例數(shù)激增的主要原因，這種現(xiàn)象也很可能反映了整個(gè)中國(guó)的狀態(tài)。然而，隨著 COVID-19 在中國(guó)的大規(guī)模傳播，繼續(xù)密切監(jiān)測(cè)是非常重要的，以便盡早發(fā)現(xiàn)任何可能出現(xiàn)的新變體。

在同期的評(píng)論性文章中，泰倫博斯大學(xué)醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院 Wolfgang Preiser 教授和 Tongai Maponga 博士寫道：「很高興看到來自中國(guó)的這些急需的數(shù)據(jù)。令人欣慰的是，這項(xiàng)研究沒有發(fā)現(xiàn)新變異的證據(jù)，但這并不令人驚訝，前期有效的疫情控制措施的突然停止充分解釋了這種激增。

然而，他們?nèi)匀恢赋觯诟鶕?jù)北京的數(shù)據(jù)對(duì)中國(guó)整體得出結(jié)論時(shí)要慎，他們提到：「在一個(gè)幅員遼闊、人口稠密的國(guó)家的一個(gè)地區(qū)發(fā)生的 SARS-CoV-2 分子流行病學(xué)并不能外推到整個(gè)國(guó)家。在中國(guó)的其他地區(qū)，其他的進(jìn)化動(dòng)態(tài)可能會(huì)展開，可能包括被人類感染的動(dòng)物物種，*終很有可能進(jìn)一步造成病毒的進(jìn)化和『回溢』。因此，嚴(yán)密的檢測(cè)仍然是必須持續(xù)進(jìn)行的。